早产儿的胃肠道功能问题主要表现在以下一些方面：
1.吸吮和吞咽反射：婴儿是靠吸吮和吞咽来摄取奶液的，但是，早产儿吸吮和吞咽的协调功能要到34周才能成熟，这些功能如果不成熟，不仅会妨碍经口摄入的充足喂养，而且也容易造成呼吸道吸入。
2.胃容量：早产儿胃容量很小，胃窦和十二指肠动力也不成熟，两者之间缺乏协调的活动，其收缩幅度、传播速度及下食管括约肌压力均是降低的，胃的排空也较慢，因此，早产儿比足月儿更易发生胃食管反流。
3.胃肠动力：胃肠道的蠕动促进食物在胃肠道的消化，早产儿胃肠道动力不成熟，胃肠蠕动往往很弱。胎儿年龄小于31周的早产儿，小肠蠕动幅度低，而且收缩也无规律，几乎没有推进性活动，只有随着胎龄的增加、胃肠功能的成熟，蠕动的频率、振幅和时间逐渐增加，才能将食物向下推动。这就是为什么小早产儿更易出现腹胀、胃潴留等喂养不耐受问题。早产儿结肠动力也不成熟，当有呼吸窘迫或感染时，常可出现类似于巨结肠的动力性肠梗阻。
4.消化吸收功能：在肠道起着重要的吸收和消化作用的是一些消化酶，早产儿这些酶类分泌少，而且活性液较低，对于营养素蛋白、脂肪、糖的吸收和消化有一定的影响。如乳糖酶在36周时才能达到足月儿水平，因此早产儿常有乳糖不耐受问题。
5.肠道免疫功能：正常的胃肠道有一定的免疫功能，可以防治细菌的合并侵入，如胃酸、肠黏膜、肠道抗体等，早产儿胃酸低、肠黏膜渗透性高、肠道抗体能力弱，因此早产儿容易发生坏死性小肠结肠炎。
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